Los organismos de dirección están compuestos por la Asamblea de Síndicos, máxima autoridad y por el Comité Ejecutivo o Comité de  Directores.

En el año 2016 el Comité Ejecutivo o de Directores lo conforman:

Carlos Alberto Méndez                         Presidente
Soraya Bhikú                                          Vicepresidenta                                                                                                                     Ramón Policart Z.                                                Secretario
Rogelio Rengifo                                      Tesorero

Al Comité Ejecutivo lo acompañan los siguientes Síndicos, miembros de la Asamblea:

Roberto Troncoso B.
J. Thomas Ford
Julio Linares F.
José F. Townshend
Rolando De León
Johnny Cheng
Ricaurte Franco
Ramón Crespo
Mike Maduro
Honorio Méndez
Ricardo Díaz-Guillén
Ricardo Acrich                                                                                                                                                                                                 Vicente Alberto Pascual
Ignacio Molino
Xenia Mas de Vergara
Konstantino Karnakis (presidente Club Activo 20-30 de Panamá                                                                                                     Carlos Carrillo (socio Club Activo 20-30 de Panamá)
Carlos F. Tarragó (socio Club Activo 20-30 de Panamá)

Directora Ejecutiva: Virginia de Alvarado

El primer lunes de cada mes se celebra la reunión de trabajo, en donde participan, además del comité ejecutivo, los síndicos que conforman la Asamblea.  Esta unión de conocimientos, experiencias,  esfuerzos y sentimientos son el motor que permite que FUNPROI vaya a la cabeza de las organizaciones que directamente ayudan a la población con discapacidad.

El Director(a) Ejecutivo (a) designado es el encargado de ejecutar las decisiones administrativas y operativas adoptadas por los organismos deliberativos.