Los organismos de dirección están compuestos por la Asamblea de Síndicos, máxima autoridad y por el Comité Ejecutivo o Comité de Directores.
En el año 2016 el Comité Ejecutivo o de Directores lo conforman:
Carlos Alberto Méndez Presidente
Soraya Bhikú Vicepresidenta Ramón Policart Z. Secretario
Rogelio Rengifo Tesorero
Al Comité Ejecutivo lo acompañan los siguientes Síndicos, miembros de la Asamblea:
Roberto Troncoso B.
J. Thomas Ford
Julio Linares F.
José F. Townshend
Rolando De León
Johnny Cheng
Ricaurte Franco
Ramón Crespo
Mike Maduro
Honorio Méndez
Ricardo Díaz-Guillén
Ricardo Acrich Vicente Alberto Pascual
Ignacio Molino
Xenia Mas de Vergara
Konstantino Karnakis (presidente Club Activo 20-30 de Panamá Carlos Carrillo (socio Club Activo 20-30 de Panamá)
Carlos F. Tarragó (socio Club Activo 20-30 de Panamá)
Directora Ejecutiva: Virginia de Alvarado
El primer lunes de cada mes se celebra la reunión de trabajo, en donde participan, además del comité ejecutivo, los síndicos que conforman la Asamblea. Esta unión de conocimientos, experiencias, esfuerzos y sentimientos son el motor que permite que FUNPROI vaya a la cabeza de las organizaciones que directamente ayudan a la población con discapacidad.
El Director(a) Ejecutivo (a) designado es el encargado de ejecutar las decisiones administrativas y operativas adoptadas por los organismos deliberativos.